MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 45128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017568	ACT	2	6	296	301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318030
2	NC_017568	ACA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
3	NC_017568	TGA	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318030
4	NC_017568	GCA	2	6	371	376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318030
5	NC_017568	TAC	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318030
6	NC_017568	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
7	NC_017568	TCATC	2	10	515	524	20 %	40 %	0 %	40 %	386318030
8	NC_017568	ACAA	2	8	578	585	75 %	0 %	0 %	25 %	386318030
9	NC_017568	TGG	2	6	691	696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318030
10	NC_017568	AAT	2	6	752	757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318030
11	NC_017568	ACGA	2	8	797	804	50 %	0 %	25 %	25 %	386318030
12	NC_017568	ATTC	2	8	805	812	25 %	50 %	0 %	25 %	386318030
13	NC_017568	ATTG	2	8	874	881	25 %	50 %	25 %	0 %	386318030
14	NC_017568	AGAA	2	8	903	910	75 %	0 %	25 %	0 %	386318030
15	NC_017568	AAG	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
16	NC_017568	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
17	NC_017568	CGCC	2	8	986	993	0 %	0 %	25 %	75 %	386318030
18	NC_017568	AGA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
19	NC_017568	ACC	2	6	1063	1068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318030
20	NC_017568	A	7	7	1100	1106	100 %	0 %	0 %	0 %	386318030
21	NC_017568	GAA	3	9	1109	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
22	NC_017568	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318030
23	NC_017568	ACTAAA	2	12	1286	1297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386318030
24	NC_017568	A	7	7	1295	1301	100 %	0 %	0 %	0 %	386318030
25	NC_017568	GCGT	2	8	1344	1351	0 %	25 %	50 %	25 %	386318030
26	NC_017568	AAGAA	2	10	1370	1379	80 %	0 %	20 %	0 %	386318030
27	NC_017568	GAA	2	6	1460	1465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
28	NC_017568	TGG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318030
29	NC_017568	ACA	2	6	1484	1489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
30	NC_017568	A	6	6	1514	1519	100 %	0 %	0 %	0 %	386318030
31	NC_017568	GAT	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
32	NC_017568	ATT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
33	NC_017568	CGA	2	6	1869	1874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318031
34	NC_017568	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
35	NC_017568	CTT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
36	NC_017568	ATT	2	6	2012	2017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
37	NC_017568	AAG	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
38	NC_017568	CAA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318031
39	NC_017568	ATTA	2	8	2071	2078	50 %	50 %	0 %	0 %	386318031
40	NC_017568	TGA	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
41	NC_017568	CAT	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
42	NC_017568	ACA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318031
43	NC_017568	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
44	NC_017568	GAA	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
45	NC_017568	TCA	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
46	NC_017568	TGAC	2	8	2400	2407	25 %	25 %	25 %	25 %	386318031
47	NC_017568	TTC	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
48	NC_017568	TAT	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
49	NC_017568	TTA	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
50	NC_017568	CGT	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318031
51	NC_017568	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318031
52	NC_017568	TCA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
53	NC_017568	TCT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
54	NC_017568	AGA	2	6	2692	2697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
55	NC_017568	ATG	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
56	NC_017568	GGC	2	6	2720	2725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318031
57	NC_017568	TTTC	2	8	2736	2743	0 %	75 %	0 %	25 %	386318031
58	NC_017568	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	386318031
59	NC_017568	GATG	2	8	2758	2765	25 %	25 %	50 %	0 %	386318031
60	NC_017568	GAA	2	6	2786	2791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
61	NC_017568	ATTT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	386318031
62	NC_017568	GAC	2	6	2846	2851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318031
63	NC_017568	CGTA	2	8	2879	2886	25 %	25 %	25 %	25 %	386318031
64	NC_017568	AAAT	2	8	3184	3191	75 %	25 %	0 %	0 %	386318032
65	NC_017568	TTG	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318032
66	NC_017568	T	6	6	3233	3238	0 %	100 %	0 %	0 %	386318032
67	NC_017568	GAA	2	6	3262	3267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318032
68	NC_017568	GCA	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318032
69	NC_017568	A	6	6	3329	3334	100 %	0 %	0 %	0 %	386318032
70	NC_017568	AT	3	6	3427	3432	50 %	50 %	0 %	0 %	386318032
71	NC_017568	GGA	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386318032
72	NC_017568	AGC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318032
73	NC_017568	TCA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318032
74	NC_017568	AAC	3	9	3570	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318032
75	NC_017568	GAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318032
76	NC_017568	TGAG	2	8	3657	3664	25 %	25 %	50 %	0 %	386318032
77	NC_017568	GC	4	8	3721	3728	0 %	0 %	50 %	50 %	386318032
78	NC_017568	AAG	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318032
79	NC_017568	A	6	6	3749	3754	100 %	0 %	0 %	0 %	386318032
80	NC_017568	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318033
81	NC_017568	GGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318033
82	NC_017568	TCT	2	6	4112	4117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318033
83	NC_017568	CGT	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318033
84	NC_017568	A	6	6	4147	4152	100 %	0 %	0 %	0 %	386318033
85	NC_017568	CAT	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318033
86	NC_017568	TTA	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318034
87	NC_017568	ACG	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
88	NC_017568	ATG	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
89	NC_017568	A	6	6	4482	4487	100 %	0 %	0 %	0 %	386318034
90	NC_017568	A	6	6	4491	4496	100 %	0 %	0 %	0 %	386318034
91	NC_017568	GTC	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318034
92	NC_017568	CAC	2	6	4597	4602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318034
93	NC_017568	AAC	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
94	NC_017568	ATT	2	6	4702	4707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318034
95	NC_017568	ACG	2	6	4740	4745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
96	NC_017568	ATC	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318034
97	NC_017568	GCA	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
98	NC_017568	TTGC	2	8	4830	4837	0 %	50 %	25 %	25 %	386318034
99	NC_017568	ATTC	2	8	4845	4852	25 %	50 %	0 %	25 %	386318034
100	NC_017568	AGA	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318034
101	NC_017568	CAA	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
102	NC_017568	AGA	2	6	4955	4960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318034
103	NC_017568	CAA	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
104	NC_017568	TGA	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
105	NC_017568	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
106	NC_017568	AAC	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
107	NC_017568	GTAT	2	8	5441	5448	25 %	50 %	25 %	0 %	386318035
108	NC_017568	CAT	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
109	NC_017568	AGT	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
110	NC_017568	A	6	6	5618	5623	100 %	0 %	0 %	0 %	386318035
111	NC_017568	TGG	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318035
112	NC_017568	CGG	3	9	5679	5687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318035
113	NC_017568	GGT	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318035
114	NC_017568	TCA	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
115	NC_017568	GTA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
116	NC_017568	TCA	3	9	5787	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
117	NC_017568	ACA	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
118	NC_017568	TAAA	2	8	5957	5964	75 %	25 %	0 %	0 %	386318035
119	NC_017568	GAA	2	6	5998	6003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318035
120	NC_017568	ATG	2	6	6086	6091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
121	NC_017568	TCA	2	6	6105	6110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
122	NC_017568	TACAA	2	10	6143	6152	60 %	20 %	0 %	20 %	386318035
123	NC_017568	CAA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
124	NC_017568	AGA	2	6	6288	6293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318035
125	NC_017568	CAG	2	6	6335	6340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318035
126	NC_017568	TTG	2	6	6419	6424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318035
127	NC_017568	TCT	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318035
128	NC_017568	CAT	2	6	6483	6488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
129	NC_017568	TGC	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318035
130	NC_017568	A	6	6	6532	6537	100 %	0 %	0 %	0 %	386318035
131	NC_017568	TAG	2	6	6641	6646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
132	NC_017568	G	6	6	6661	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	386318035
133	NC_017568	ACA	2	6	6764	6769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
134	NC_017568	GGC	2	6	6811	6816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318035
135	NC_017568	GTT	2	6	6897	6902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318035
136	NC_017568	TTC	2	6	6910	6915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318035
137	NC_017568	TTGA	2	8	6934	6941	25 %	50 %	25 %	0 %	386318035
138	NC_017568	ACC	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318035
139	NC_017568	TAT	2	6	7003	7008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318035
140	NC_017568	ACA	2	6	7123	7128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
141	NC_017568	GAT	2	6	7168	7173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
142	NC_017568	TCG	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318035
143	NC_017568	TCG	2	6	7451	7456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318036
144	NC_017568	A	6	6	7506	7511	100 %	0 %	0 %	0 %	386318036
145	NC_017568	GATG	2	8	7649	7656	25 %	25 %	50 %	0 %	386318036
146	NC_017568	ATT	2	6	7715	7720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318036
147	NC_017568	GATT	2	8	7742	7749	25 %	50 %	25 %	0 %	386318036
148	NC_017568	CAC	2	6	7864	7869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318036
149	NC_017568	ACA	2	6	7870	7875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318036
150	NC_017568	GTG	2	6	8068	8073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318036
151	NC_017568	A	6	6	8137	8142	100 %	0 %	0 %	0 %	386318036
152	NC_017568	A	7	7	8163	8169	100 %	0 %	0 %	0 %	386318036
153	NC_017568	TGA	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
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155	NC_017568	ATGCGA	2	12	8245	8256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386318036
156	NC_017568	TA	3	6	8275	8280	50 %	50 %	0 %	0 %	386318036
157	NC_017568	AACA	2	8	8281	8288	75 %	0 %	0 %	25 %	386318036
158	NC_017568	CAT	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318036
159	NC_017568	AAGC	2	8	8358	8365	50 %	0 %	25 %	25 %	386318036
160	NC_017568	AAG	2	6	8392	8397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
161	NC_017568	CGT	3	9	8403	8411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318036
162	NC_017568	CA	3	6	8446	8451	50 %	0 %	0 %	50 %	386318036
163	NC_017568	TGA	2	6	8486	8491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
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165	NC_017568	GAA	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
166	NC_017568	CGA	2	6	8756	8761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318036
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169	NC_017568	AGA	2	6	8801	8806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
170	NC_017568	AGA	2	6	8822	8827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318036
171	NC_017568	AAC	2	6	8853	8858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318036
172	NC_017568	TGA	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318036
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178	NC_017568	A	6	6	9171	9176	100 %	0 %	0 %	0 %	386318036
179	NC_017568	TTAA	2	8	9180	9187	50 %	50 %	0 %	0 %	386318036
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230	NC_017568	T	6	6	12476	12481	0 %	100 %	0 %	0 %	386318038
231	NC_017568	GTG	2	6	12505	12510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318038
232	NC_017568	GAT	2	6	12512	12517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318038
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243	NC_017568	GAA	2	6	13322	13327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318039
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246	NC_017568	GAT	2	6	13394	13399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318039
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250	NC_017568	TAG	2	6	13614	13619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318039
251	NC_017568	GT	3	6	13656	13661	0 %	50 %	50 %	0 %	386318039
252	NC_017568	CGTTT	2	10	13670	13679	0 %	60 %	20 %	20 %	386318039
253	NC_017568	ACA	2	6	13747	13752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318039
254	NC_017568	ATG	2	6	13766	13771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318039
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257	NC_017568	CTG	2	6	13878	13883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318039
258	NC_017568	ACT	2	6	13899	13904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318039
259	NC_017568	AGA	2	6	14083	14088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318039
260	NC_017568	CGT	2	6	14138	14143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318039
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262	NC_017568	GCG	2	6	14366	14371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318039
263	NC_017568	GGT	2	6	14438	14443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318039
264	NC_017568	TGC	2	6	14903	14908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318040
265	NC_017568	GCA	2	6	14932	14937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318040
266	NC_017568	TAT	3	9	14943	14951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318040
267	NC_017568	GAT	2	6	15000	15005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318040
268	NC_017568	TTA	2	6	15025	15030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318040
269	NC_017568	CATA	2	8	15069	15076	50 %	25 %	0 %	25 %	386318040
270	NC_017568	GGGTAG	2	12	15077	15088	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386318040
271	NC_017568	TTG	2	6	15094	15099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318040
272	NC_017568	TTGGA	2	10	15260	15269	20 %	40 %	40 %	0 %	386318040
273	NC_017568	CGAAAT	2	12	15326	15337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386318040
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277	NC_017568	GTTT	2	8	15392	15399	0 %	75 %	25 %	0 %	386318040
278	NC_017568	CGA	2	6	15443	15448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318040
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280	NC_017568	TCA	2	6	15520	15525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318041
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282	NC_017568	TTCA	2	8	15633	15640	25 %	50 %	0 %	25 %	386318041
283	NC_017568	CAA	2	6	15642	15647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318041
284	NC_017568	ATG	2	6	15654	15659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318041
285	NC_017568	ATC	2	6	15684	15689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318041
286	NC_017568	ATT	2	6	15788	15793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318041
287	NC_017568	CATTAG	2	12	16074	16085	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386318042
288	NC_017568	GCCA	2	8	16158	16165	25 %	0 %	25 %	50 %	386318042
289	NC_017568	TCG	3	9	16167	16175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318042
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292	NC_017568	GA	3	6	16239	16244	50 %	0 %	50 %	0 %	386318042
293	NC_017568	G	6	6	16253	16258	0 %	0 %	100 %	0 %	386318042
294	NC_017568	TCA	2	6	16411	16416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318042
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373	NC_017568	ACA	2	6	20087	20092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318044
374	NC_017568	TAAAGG	2	12	20155	20166	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386318045
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376	NC_017568	A	7	7	20274	20280	100 %	0 %	0 %	0 %	386318045
377	NC_017568	ACAA	2	8	20298	20305	75 %	0 %	0 %	25 %	386318045
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381	NC_017568	CA	3	6	21067	21072	50 %	0 %	0 %	50 %	386318046
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385	NC_017568	GAT	2	6	21197	21202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318046
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387	NC_017568	CA	3	6	21257	21262	50 %	0 %	0 %	50 %	386318046
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